百日咳和过敏性咳嗽是两个不同的疾病，两者的区别如下：
1、病因不同
（1）百日咳是由百日咳杆菌引起的呼吸系统疾病，可通过呼吸道飞沫传播，具有高度的传染性。常见于儿童和青少年。
（2）过敏性咳嗽主要是由于接触环境中的花粉、灰尘、尘螨、动物皮屑、刺激性气体等而引发的疾病。其具体的发病机制尚未明确，可能是由于患者存在某些基因缺陷，导致免疫系统受到过敏原刺激时会发生功能紊乱。
2、症状不同
百日咳和过敏性咳嗽患者都有咳嗽的症状。两者的区别如下：
（1）百日咳患者主要表现为阵发性痉挛性咳嗽，其特点为成串的、接连不断的咳嗽后，伴一次深长吸气，由于大量空气急促通过狭窄的声门，会发出一种类似"鸡鸣"样吸气性吼声，随后又发生一次痉咳，反复多次，直至咳出大量黏稠痰液。患者往往夜间咳嗽更严重
（2）过敏性咳嗽患者常在接触过敏原后出现咳嗽的症状，一般为阵发性、刺激性的干咳，患者常感到咽喉发痒或异物感，但可无痰液。症状在白天或夜间均可发生。
3、治疗方法不同
（1）百日咳属于传染性疾病，一般会对患者采取相应的隔离措施，早期应用阿奇霉素、克拉霉素、左氧氟沙星等抗菌药物治疗。
（2）过敏性咳嗽不是传染性疾病，患者不需要隔离治疗，只需要注意避免过敏原的接触。医生针对患者的实际病情，使用糖皮质激素或抗组胺药物（如氯雷他定）来治疗。不存在细菌感染时，医生一般不会使用抗生素来治疗。
4、预后不同
（1）百日咳一般为急性发作、病程较长、恢复比较慢。患者一般经抗生素药物治疗后多可治愈。但是如果合并有脑、肺等脏器并发症时预后较差。
（2）过敏性咳嗽的病因较为复杂，预后也不尽相同。如果可以明确诊断，找到具体的过敏原，针对过敏原进行脱敏治疗，则有可能治愈，但所需的时间也会相对较长。临床上一般建议早期发现、早期对症治疗，以争取达到一个良好的预后。
