您好，先天性胆道闭锁的具体病因尚未完全了解，主要有以下两种学说：
（1）先天性发育畸形学说：胚胎早期（为胚胎期2-3个月），原始胆管已形成，因上皮细胞过度增殖，胆总管和胆囊管的管腔一度消失，以后，随着腔内上皮细胞空泡化并相互融合重现胆道系统。若此时发育障碍，胆管无空泡化或空泡化不完全，则形成胆道全段或部分闭锁。本病与染色体异常有关，常合并下腔静脉缺如、门静脉异位、内脏易位等。
（2）病毒感染学说：越来越多的学者认为，该病可能是病毒感染引起的获得性病变而不是先天性疾病。胎儿期或新生儿期病毒感染引起肝脏或胆道炎症胆管内皮细胞及胆管周围纤维组织增生，导致胆管纤维化、闭塞。出生后炎症可持续进行，闭塞程度及累及范围进一步加重。乙型肝炎病毒是主要致病病毒，母亲常为乙型肝炎病毒携带者，可通过胎盘传给婴儿。
