十二指肠球部溃疡通常为联合用药治疗，患者可在专业医师指导下选用下列药物：
1、抑制胃酸分泌药物：该类药物可抑制胃酸的分泌，减少其对十二指肠黏膜的刺激。质子泵抑制剂（PPI）是首选药物，PPI可在2~3天内控制溃疡症状，常用的有奥美拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑等；H2受体拮抗剂也是主要药物之一，疗效好，用药方便，价格适中，长期使用不良反应少，常用药物有法莫替丁、尼扎替丁、雷尼替丁。
2、根除Hp的药物：对于有幽门螺杆菌（Hp）感染的患者，应早期积极根除Hp。治疗幽门螺杆菌目前倡导的联合方案为含有铋剂的四联方案，即1种PPI+2种抗生素和1种铋剂，疗程10~14天。常用的抗生素有克拉霉素、阿莫西林、甲硝唑等；常用的铋剂有枸橼酸铋钾、果胶铋等。
3、保护胃黏膜的药物：保护胃黏膜常用药有铋剂和抗酸剂。常用的抗酸剂有碳酸钙、氢氧化铝凝胶等，这些药物可中和胃酸，起效较快，可短暂缓解疼痛，但很难治愈溃疡；铋剂在酸性溶液中呈胶体状，覆于溃疡表面，阻隔胃酸和胃蛋白酶对黏膜的侵袭损害，由于肾脏为铋的主要排泄器官，故肾功能不良者应忌用铋剂。
