公元604年七月十三日，隋文帝杨坚死在了仁寿宫大宝殿，这一点毫无疑问，但隋文帝究竟是怎么死的？则主要有两种说法，一说是自然病死的，二说是被太子杨广害死的。
首先来看自然病死的说法，出自于《隋书》。
仁寿四年，也就是604年，隋文帝杨坚病重，他感到自己时日无多，于是准备安排后事。
七月十日，隋文帝召见文武百官，和他们告别，嘱咐他们要辅佐好太子杨广。晚些时候，隋文帝又召见了一个叫何稠的人，这个人曾为他的皇后独孤伽罗修建陵寝，所以他将自己的身后事也交付给他办理。
然后，隋文帝又单独叫来的太子杨广，搂着他的脖子说，“何稠用心，我付以后事，动静当共平章。”平章就是商量讨论的意思，嘱咐杨广跟何稠商量着办自己的后事。
三天以后，隋文帝驾崩于仁寿宫大宝殿，终年六十四岁。
第二种说法是被杨广害死的，出自于《资治通鉴》。
根据记载，隋文帝在入住仁寿宫之后，病情逐渐沉重，已经到了生命的最后阶段，当时陪在他身边的有儿子、有妃子、有大臣。
儿子当然是太子杨广，妃子是他晚年最宠爱的女人叫做宣华夫人，大臣有三个，分别是尚书左仆射杨素、兵部尚书柳述和黄门侍郎元岩。这三个都是隋文帝晚年最信任的三位重臣。
老皇帝将死、新皇帝将立，这个时期正是一个王朝在政治上最为敏感的时候，很多别有用心的人会蠢蠢欲动，操作稍有不慎，便可能引发政变，导致时局动荡。
因此，太子杨广为了保证能够顺利接班，便向倾向于自己的杨素询问该如何处置，以防不测。杨素就给杨广写了一封信，详细地指点杨广该如何如何，讨论的都是隋文帝死后的相关事宜。由于是私人信件的原因，估计信中用语对隋文帝可能就不是很尊敬。
但是，不知道什么原因，这封信居然没送到杨广手里，而是送到了隋文帝的手里。可想而知，隋文帝在看到这封信之后，心中必然十分愤怒。毕竟老子还没死呢，你俩这就开始讨论接班掌权的事了。
不过，隋文帝虽然生气，但从理性上讲，杨广这么做并不过分，毕竟这也是有利于国家稳定的，隋文帝当了几十年的皇帝，不可能不明白这个道理，所以他虽然生气但并未发作。
但接下来的一件事真的让隋文帝愤怒了。
在皇后独孤伽罗死后，隋文帝晚年最宠爱的女人是宣华夫人，宣华夫人姓陈，是南方陈朝最后一个皇帝陈叔宝的妹妹，亡国后便被隋文帝收入了后宫。
这天早上，宣华夫人外出上厕所，回来后神色有异，隋文帝追问之下，宣华夫人这才含泪说道，“太子无礼！”说出了刚才出门时，太子杨广调戏自己，自己强行挣脱才跑了回来。
隋文帝大怒，自己的宠妃，那得算是杨广的“小妈”啊，儿子调戏老子的妃子，已经是不伦之事，更何况自己还没死呢。于是隋文帝拍打着床说道，“这个畜生，我怎么能把国家托付给他呢？独孤误我！”（隋朝太子原为长子杨勇，在独孤皇后的一力支持下，才废杨勇改立杨广。）
接着，隋文帝召见了兵部尚书柳恕和黄门侍郎元岩，让他们叫废太子杨勇过来，准备废掉杨广，重新恢复杨勇的太子之位。
当时陪在隋文帝身边的有三个大臣，之所以只叫了柳述、元岩两人，而没有叫杨素，那是因为杨素和太子杨广早已勾结在了一起，这一点隋文帝早已心知肚明，之前又看到了杨素写给杨广的信，这才将其排除在外，以防泄密。
但是，消息还是走漏了，杨素马上就知道了此事，并迅速汇报给了杨广。杨广得到消息后，知道这是事关生死的大事，于是当机立断，紧急调动手下的军队进驻仁寿宫，矫诏逮捕了柳述和元岩，将伺候隋文帝的所有宫女和宦官囚禁起来，并控制了仁寿宫，不准任何人出入。
当天晚上，隋文帝驾崩于仁寿宫。史称“仁寿宫变”。
隋文帝最终的死法，《资治通鉴》中没有记载，但唐人笔记中记载了两种说法，一说是杨广让人毒死了隋文帝，二说是杨广让人活活打死了隋文帝。总之，杨广成了弑君弑父的贼子。
对两种说法的分析
以上两种说法，都是出自于正史，《隋书》和《资治通鉴》在史学上的可信性几乎一样高，所以我们很难分辨哪一种才是历史的真相。但根据逻辑分析，第二种说法颇有疑问之处。
首先，杨广调戏宣华夫人的事有疑问。皇权更替是一个朝代最为敏感的事情，在这段时间里，杨广更应该考虑的是如何平稳地从隋文帝手里接过皇位，不会冒着巨大的政治风险去调戏宣华夫人，他应该知道这对他极为不利。
退一步说，就算杨广好色，见到了宣华夫人的美貌后，情不自禁动手调戏，但此时隋文帝已经离死不远了，宣华夫人为了自己以后的荣华富贵着想，也绝不会向隋文帝告发杨广，否则杨广继位之后，岂有她的好果子吃？
唯一可以解释的是，宣华夫人本是陈朝后主的妹妹，而隋朝灭了陈朝，宣华夫人为了国仇家恨，陷害杨广。但这也说不过去，因为此时距陈朝被灭已经过去了十五年，宣华夫人被纳入后宫时不过十一二岁而已。更何况，杨广在和杨勇争夺太子位时，宣华夫人是为杨广出过力的，在隋文帝耳边说了不少杨广的好话，又怎么可能在这个时候突然陷害杨广呢？
此外，隋文帝当时已经病重，在此之前都已经和文武大臣们告别过了，就是说隋文帝本人都觉得自己已经时日无多了。当杨广的军队入驻仁寿宫后，实际上已经控制了隋文帝，隔绝了他和外界的联系，实在没有必要下手害死隋文帝，让自己背上弑君弑父的千古骂名。
对此，蒙曼教授曾提出过自己的见解，她认为，隋文帝在弥留之际，看到了杨素写给杨广的信后，大怒。此时伺候在他身边的柳述和元岩趁机劝说隋文帝废杨广，重立杨勇为太子。或者说，隋文帝那时候已经意识模糊，柳述和元岩根本就是矫诏，要谋立杨勇为太子，继承皇位，以保自己今后的荣华富贵。
此事被杨素知道，告知了杨广，这才有了杨广发动“仁寿宫变”的事情。
综上所述，隋文帝杨坚是在自己病重，即将不治的时候，遇到了杨广发动政变，将他囚禁，杨坚一气一急一怒之下，已经奄奄一息的他再也经不住折腾，当晚就病逝了，所以我的结论是：隋文帝杨坚是病死的，但却不是自然病死的，而是在重病的情况下，被儿子杨广气死的！
