按照地球生命进程来看，人类发现的最早的生物化石证明，地球生命起源于35亿年前，17世纪，有一位学者写下了著名的“生命配方”：把一件脏衣服放进容器，接着添加一些小麦，发酵21天，老鼠就会从中诞生。

然而最近，科学家在格陵兰西部地区发现的证据显示，生命可能早在大约38亿年前就已在地球上存在。他们便是微生物生命。不可思议的是，它们在地球所遭遇的有史以来最猛烈的轰炸中，竟然能存活下来。而就是在这次轰炸中，一个像火星般大小的巨型岩石冲撞了地球，地球的外层因此气化，碰撞产生的残骸则聚合成了月球。这次碰撞的力度是如此之巨大，如果此前地球上存在过任何构筑生命大厦的“砖头”的话，这些“砖头”都必定会在这次大碰撞中全军覆灭。这就不由得让人猜测：“生命大厦”的“奠基石”并不是在地球上铸造的，而是来自于外太空。

需要经历10亿年至20亿年时间，原始微生物所产生的氧气数量才足以改变整个地球大气层。正是因为细菌们长期不懈的辛勤工作，才为我们所熟悉的多细胞生物——动植物以及这些动植物所赖以生存的环境的出现奠定了基础。总而言之，微生物统治地球达30亿年以上，也就是地球历史的三分之二。

那么如此来推算的话，地球距今已经有46亿岁了；

上图为草履虫，最早的单细胞微生物生命距今38亿年；

根据不同时期说法不同，暂且算多细胞生物距今可能有21亿年；

最早的脊椎动物化石，距今5.1至5.2亿年左右。就是上图的样子。

最早的爬行动物，距今大约3亿年。

现代人类最早的化石，仅仅在距今大约8万至12万年前。

按着这个发现的时间比例来讲，从猿猴进化成人是不可能的，那么所谓的进化，也仅仅是从原始人类进化成现代人类。

说到进化论最被大家诟病的地方，大概就是“进化”这个词了。因为现代综合进化论认为，生物是随环境变化产生的生存压力而不断演化的。这个“演化”和“进化”相差甚远。因为演化是没有从低级到高级这一说的，只是环境变化决定了生物的发展方向，而突变的基因使生物基因库（基因库指的是这个物种所有基因的出现频率）频率发生变化，最终发生质变的结果。比如说现在一些溶洞中发现的鱼类和虾类，因为不需要眼睛，所以纷纷退化了，身体也变得透明。这不是变低级了，而是依旧遵照演化规律。但可惜的是，进化这个词被大家所熟悉，无法改变，所以就将错就错了。这跟大熊猫的叫法有些类似（按照分类，大熊猫应该是大猫熊）。当然，这些都不是事，最多容易误导大家，觉得生物一直在有意识得进化一样。

不过，说到漏洞，进化论当然也有，需要后人修修补补不断完善，这很正常。任何理论都不是一次成型的，达尔文也只是发现了这个规律，但是在细节上有点让现代的科学家头疼。说几个争议比较大的给大家做一个参考吧。第一，按照达尔文进化论观点，演化是一个漫长的过程，是不断循序渐进发展出来的。所以，用它解释寒武纪脊索动物成指数爆发出现有些困难。这就是达尔文当时没有想到的。所以现代综合进化论对这一点做出了修正，认为生物在突然获得某种决定性转变的时候，发展会出现跳跃式前进。比如当单细胞生物接纳了线粒体（线粒体原本是原核生物，结果和其他细胞共生，变成了细胞的“能量工厂”）就是一个里程碑式的转变。所以在物种演化上存在瓶颈效应，而这就是给达尔文进化论贴上的补丁。此外，为什么找不到中间过渡物种，也可以用这种效应解释。不过，说实话，人类对一种东西的演化历程的把握，已经可以回答这个问题。那就是对于曾经人类的头号杀手，鼠疫的研究。近万年的演化过程之清晰，让人咋舌。

所以，漏洞这件事，就是科学家在努力研究的东西。一个完美的理论只配写在教科书里，而科学家面对的永远都是矛盾与困惑。

之前看过一个文章，最大的缺陷是地质化石证据的缺失，比如鸡鸭鹅都是从同一种鸟类演化来的，那么根据达尔文的理论，除了鸡鸭鹅，中间进化的过程中还会有鸡头鸭身，鹅脖鸡身，鸭头鹅身等各种各样的形态存在，最终鸡鸭鹅被自然选择存活到了今天。但是基因突变是随机的，要产生鸡鸭鹅这三种动物，可能需要产生数亿个物种，打个比方，1到1000你随意选择3个数字，我来猜是哪三个，猜中的概率是十亿分之一，那么除了猜中的那次，剩下的数字算是废弃品，同样，产生鸡鸭鹅的过程需要无数的废品，都被自然选择在亿万年中淘汰掉了，那么如果你去挖，鸡鸭鹅的化石一定是远远少于这些过渡物种的，可是事实是，我们从来没有发现过这些过度物种的证据，这是这个理论最大的bug。达尔文的信徒以地质勘探不足为理由搪塞，实际上我个人觉得完全是扯淡，当然鸡鸭鹅只是比喻，今天能挖出猛犸象的化石，怎么就没挖出一个物种向猛犸象演变的化石呢？按说进化过程中的废品淘汰品数量级要远超过最终成品呀！反正进化论我个人是不信的，只是现在学术界也没有更靠谱的理论，大家只能选择相信，哈哈

达尔文在1859年发表的“物种起源”一书中表达了生物进化论的主要理论“用进废退、物竞天择、适者生存”，是对生命起源和发展的一种假说。这一理论是对当时流行的神学论主张的“人是上帝创造的”的批判。有趣的是，在1828年～1831年达尔文在英国剑桥大学攻读神学，正是他的神学老师推荐他参加一次航海旅行，他在船上种植植物，发现了植物的趋光性，也就是向着阳光生长的奥秘，这使他对自然环境对生物的影响产生了浓厚的兴趣。

生物进化论中一个重要的内容是进化，也就是现有的物种是从别的物种进化来的，一个物种可以变成新的物种，也就是比如灵长类，人、猩猩、猴子都有一个共同的祖先，我们都是从某一个共同的物种进化来的。而这个共同的祖先已经不存在，因为他们已经进化成了人等其他物种。生物进化论的另一个内容是进化的动力是自然选择，是自然迫使物种不断进化。

这个理论其实非常笼统和宽泛，如果非要说漏洞，一个漏洞是达尔文当时没有把物种之间的相互影响，也就是物种的共生和寄生考虑进去，达尔文的进化论更多的是侧重自然力迫使物种向某一方向进化，也就是进化是有方向性的，是自然环境确定了进化的方向。但有这样一种可能，那就是进化是偶然或者突发事件导致的，是两个或多个物种碰撞融合产生了新物种，不一定是有方向的，是突然发生的。

有科学证据表明某些物种进化的源动力来自于两种以上物种的共生，比如人和病毒。达尔文想不到这一点很正常，因为在达尔文时代人们还不知道有病毒这么个物种，也不知道人类的胎盘形成是因为人类祖先感染了一个逆转录病毒造成的。我在以往的回答“病毒有没有可能与生物构成共生关系？”中有阐述，我们人类基因中的8%都是病毒片段，如果在历史上的某一个时间，我们的祖先没有感染病毒，病毒没有整合到人类的卵细胞中并一代一代遗传下来，也就不会有人类的存在了。

研究发现这些病毒片段在黑猩猩和猴子身上也存在，但人类的内源性逆转录病毒和大猩猩的更加接近，所以可能是不同的病毒感染了我们的祖先，整合到基因组的不同位置导致了进化的不同方向。所以进化不一定是有特定方向的，也不一定是一个物种定向的进化成某一新物种，而可能是一些突发事件，以及两种以上物种的共生和融合产生了新的物种。

图片展示了各种不同的内源性逆转录病毒（ERV）是如何通过感染可能导致了灵长类的进化。

(https://www.helmholtz-muenchen.de/viro/research/retroviral-persistence-in-humans/human-endogenous-retroviruses/research-topics/index.html)

很高兴回答你的问题。

首先，谢邀。

其实进化论是现在最科学和经得起考究的一门学科了。在任何高校里，反对进化论的都很少。考古、古气候学、基因学等层面的研究，都在一定程度上支撑着进化论。

那么进化论还存在什么样的漏洞，或者bug呢？

仔细研究下进化论，就不难发现，这个问题的核心来自于：

进化的中间产物。

是的，鹿进化成长颈鹿的话，那么你见过半长不长的中间体的化石么？虫子进化成鱼，你见到了有报道发现有腮的虫子的化石么？

所以，这种进化中间的副产品、或者说异类，如果数目过少，那么就很难在基因表达上占优，也就不存在后面新的种族。但如果数目很多，就不应该在考古过程中，无法找到证明这个进化中间产物存在的证据！

如果觉得有用，您就给点个赞、粉个好友呗。

大约花费0.3KB的流量，哈哈哈哈哈。

毕竟，我辣么萌~

我可以断言:这个问题下列举的的“漏洞”，99%都不只是因为了解得还不够多、不够新。

目前进化论已经是一个相当成熟的理论，而且看来近几十年还没有反例出现的可能。但是除了专业前沿的极少数研究者，大多数人对生物进化知识的了解都还停留在30-50年前的成果，而这些疑问的绝大多数都在这半个世纪中得到了解答。

比如有人疑问为何低等的细菌和高等动物同时存在于现代。这是因为生物进化是“适者生存”，而不是“高者生存”，低等也有低等的优势——比如体型小、能耗低、繁殖快。所以在高等生物钻不进去、看不上、忍受不了的边边角角，仍然有低等生物生活的空间。

比如有人问人类进化的缺失环节。实际上它已经在上世纪90年代在非洲发现了。而且不仅是化石，还包括通过DNA分析绘制了人类的进化树、确定了我们智人与各种猿猴猿人和其他人类亚种分化的时间、确定了进化发生的地点与环境动力、甚至确定了人类文化的起源。建议可以去B站看看纪录片《人类的旅程》或搜索“人类 进化”，其中有详细解释。

再比如质疑恐龙为什么没进化出智力的。近些年新发现的几个事实是——其实我们哺乳类比恐龙出现得更早，进化的时间更长；有些种类的恐龙其实很聪明，智力已经达到猿猴的水平；智慧进化的路上，我们的祖先灵长类并非唯一的候选人，甚至不是种子选手，只是在最后一关我们智人抢先了一步，把别人（包括且不限于海豚、虎鲸、章鱼等，甚至包括我们的表兄弟尼安德特人等）挤下去了。——说白了就是我们走了狗屎运而已。

又比如眼睛的产生。这个疑问大约是60年前提出来的，目前已经有完整的证据链了。包括生物的各个进化阶段的眼睛——不完整，但都能用；包括不同类型眼睛的进化过程；包括这些进化过程的基因演化过程等。实际上眼睛的进化过程反而是目前进化论用来反驳神创论的经典案例了。

还有一些回答里的其他疑问，实际上在生物学领域也都已经有了解答。我这里就不一一解释了，请感兴趣的朋友善用百度。

这个问题也一直是我最关心的问题，我可以先简单的回答一下。

这里的生物进化论应该特指达尔文的生物进化论。达尔文的生物进化论有一个核心:自然选择。通俗的说就是达尔文认为所有物种都是从一个或几个极少的原始生物演变而来的。

达尔文生物进化理论从诞生第一刻起，就是不完美的，在达尔文的《物种起源》里，达尔文自己也说到没有搞清楚寒武纪生命大爆炸这一现象，并且当年达尔文把初稿送给当时著名的考古学家，古生物学家路易斯.阿加西斯，阿加西斯认为化石记录尤其是寒武纪生物大爆炸的化石记录是达尔文理论里无法逾越的难关。

达尔文的自然选择产生新物种取决于三个不同因素:随机产生的变异，变异的遗传可能性，生存竞争。并且认为新物种的产生是一个漫长的积累过程。

现在所有的化石记录均不能支持达尔文的观点，没有中间形态物种的化石。现实中我们看到的新物种的产生都是一代产生的，植物里面的月见草，动物里面两栖动物的孤雌生殖等现象都是一次突变产生新物种。

从分子生物学角度来看随机产生的变异的话就更有意思啦，基因个别碱基产生的突变，大部分是无义突变和有害突变，并且突变一般产生的是新基因型，改变的只是基因的分布频度，地理隔离无非造成的是基因的漂移，产生不了新基因，这样的小变异产生不了新物种，只会丰富物种多样性。

人和大猩猩的基因同源性在98%以上，但是是两个物种，唯一的差异是人是23对染色体，而大猩猩是24对，微观上看感觉是大猩猩和人的共同祖先的两对染色体融合成一对染色体，即人的第二对染色体，导致人类的产生，但是像染色体级别的突变全部是有害突变，就有些像遗传物质界发生了一次大的大陆板块漂移一样，这样的发生概率本身非常的低，99.99%概率都是致死突变，如果历史上真的是在自然的情况下发生的，就需要这样的假设，第一，在同一个时间点，上下左右不超过20年吧，不然跨代太多啦，第二，同一个地点，不能超过100公里吧，古代有没有电话什么高科技，第三，并且是男女同时发生了相同的位点融合;第四，媒婆还必须让他们看上眼了并结合啦;第五，女方还必须要多子女或者，方圆百里同时产生了好多对这样的突变才行，不然没法产生下一代呀。

我假设说完了，大家什么感觉，这不像大自然的事件，倒像是实验室的工作吧。

不知道有没有提说过最简机械理论，就是说一个有功能的机械装置所需要的配件一个都不能少，少一个便不能工作，生命也是这样由不同的机械装置做成的，比如细菌的鞭毛，就是一个最简单的摇动装置，由如干个不同功能的蛋白组合在一起起到鞭毛摆动的功能，一旦缺少一个蛋白，鞭毛就无法工作，对于细菌来说就是有害突变，并且这几个蛋白必须同时正确的产生，并且还是有目的性的。大自然有这么智慧吗？有没有感觉有点实验室的味道呢？

表观遗传学的研究越来越热，随着研究的深入发现所谓表达蛋白的基因的作用越来越小，基因的调控越来越复杂，如果把遗传物质(基因)看成一个菜谱的话，我们发现我们还没有找到厨师，到底是谁在决定什么时候做什么菜，什么时候上菜，菜做多少量，菜谱(基因)里面并没有记载。

随着表观遗传学学的深入研究，拉马克的用进废退的观点也并非一无是处，环境或食物对人的影响是可以遗传的，生命科学的研究越来越进入了玄学，但也越来越清晰啦。

我举过智能机器人的例子来形容达尔文的进化论，可以参看我的微头条。

不在多说了，达尔文的进化论现在来看漏洞百出，只能解释一个物种的演化，解释不了物种的产生，这也许就是达尔文进化论所面临的现状。

我说一下进化论的三个BUG。第一，一些历史悠久的物种，比如独霸地球数亿年的恐龙为何没有进化出智慧？相比之下人类的祖先才出现了几百万年。按所谓“进化”的原理，存在时间越长的物种越有资格进化。第二，既然猴子和人类的祖先同样经历了严酷的自然环境演变过程，然而为何人类祖先最后演变成了人类，猴子还是猴子？他们各自经历过什么？第三，人类在数万年前驯化了动物，比如猪牛羊猫狗鸡鸭，畜牧业产生了，然后人类在饲养家禽家畜的过程中，发现动物有自救本能，比如家猪被毒蛇咬了，中毒之后，家猪会主动跑到森林中大量进食某种植物，然后睡一觉就解毒了，这个现象被原始人发现并模仿，最终诞生了中医草药学。请问，用进化论如何解释动物自救本能？第一个发现这种植物能够解毒的动物祖先是如何发现这种植物的？然后动物祖先是如何将这些信息传递给下一代的？对于本能的理解，也有助于解释人类的初生婴儿是如何学会吃奶的？

进化论的漏洞非常多！

首先，就是它违反了热力学第二定律，即可以使熵减小。但是，我们看到的事实是，熵都是增加的。比如你燃烧煤炭、木头以后，只能形成灰烬和雾霾。而灰烬和雾霾显然是比煤炭和木头更无序的东西！那么按照达尔文的进化论，各种物种在进化的过程中，就是依靠变异不断的将优秀的基因保留下来，最终形成更优秀的物种。比如从古猿到人，就是这样。但是，实际上在现实生活中，上一代到下一代越来越优秀的例子反而并不多。比如，中国古代各个朝代，开国之君都是经过严格淘汰后的优胜者，因此一定都很优秀。而其继任者虽然也有优秀的，但是数量就大幅度下降，代代相传，后世虽然有明君，但是相对于由一个开国皇帝，变成成百上千的后代以后才产生一个明君，实际上恰恰说明皇帝家族即使优选配偶以后也没有实现所谓的进化，反而是在退化。最终甚至在明朝和清朝后期都出现君王不孕不育的状况。

其次，就是无数的观察实例也是进化论不能解释的。比如为什么古猿在环境变化之后，就能逐步进化成人类。但是蟑螂和银杏等物种就可以历经几亿年却不进化？再比如为什么寒武纪物种会大爆发，如果进化论成立，它们为什么就可以用那么短的时间进化？所以，一遇到别人质疑，左手拿着环境变化，右手拿着变异，进行诡辩，实在是有违科学精神啊！

从小就学进化论，曾经对达尔文的这套理论深信不疑。后来知道遗传基因了，觉得进化论确实有所遗漏。人类和黑猩猩的基因很相似，于是有人猜测这是“进化”的结果。不过进化干嘛力量变小了，身上的毛也进化掉了？身上有毛可以抵御寒冷啊。人类的视力、嗅觉、听觉都不咋样，不是说物竞天择、适者生存吗？还有，人生孩子很吃力，怎么可以这样进化呢？还有，熊会冬眠，这种过冬方式挺不错的，如果有人说这是进化的结果谁信啊？冬天到了，老虎狮子老鼠狐狸和人一起冬眠，不会冬眠的物种都灭绝，那才叫进化论。还有海龟生蛋，这都是什么落后的繁殖方式，早就该进化了。大象的长鼻子你非要说是进化出来的，我只有呵呵了，看看章鱼的触手那才叫进化，有你进化鼻子的功夫咱进化几条触手不好吗？