2003年4月7日，美军攻入巴格达附近，两天后巴格达陷落，萨达姆前往清真寺意欲出城未果，又两天后与儿子乘坐破旧的日产汽车成功出城。同年，12月13日萨达姆在家乡提克里特被俘，前后共八个月零两天。
萨达姆的卫队通常由三十多辆车组成，每辆车配备三至五名保镖，而在巴格达陷落的前几天，仅剩下三辆汽车和六名保镖。在美军刚攻入巴格达时，把守萨达姆总统府的二十五名警卫跑的只剩下两人。
政府高官也是作鸟兽散，留下的寥寥无几。这让萨达姆第一次体会到世态炎凉与人情冷暖，逃亡的过程更是东躲西藏，食不果腹。巴格达陷落当天，萨达姆乘车前往哈尼法清真寺，强忍泪水做了最后一次讲话。
演讲结束后，乘坐库塞驾驶的防弹奔驰准备出城，当时美军对出城的各个路口都进行设卡，萨达姆选择了等待。两天后，萨达姆一行成功出城，之后便与儿子分开逃亡。据披露，萨达姆早已将萨拉赫丁视为最佳逃亡地。
萨拉赫丁省有三百万人口，萨达姆的老家提克里特就在这一地区。这里有萨达姆的部族和家族，其中有五个家族与萨达姆关系密切，为其准备了万无一失的避难场所。这些人都是萨达姆的生死之交，铁杆支持者。
这些部族成员对于萨达姆来说，比千军万马还管用。他们不仅熟悉地理地形，而且清楚如何躲过美军的侦查。当时美军在提克里特布有重兵，还有卫星全天候的监视。部族们为他准备了三十个不同的藏身处。
萨达姆的藏身处，有的是些豪华的别墅，有的是普通农家，还有些是破旧的车库。这些藏身处都有很多的地道和地洞，而且都靠近大路与河流。藏身建筑的主人平时都与萨达姆来往不多，但却是绝对忠诚。
其实逃亡对萨达姆来说并不陌生，他早年就是在逃亡生涯中成长起来的。但六十六岁的萨达姆身体已大不如往日，此时的逃亡对他确实挑战不小。换上阿拉伯长袍和蓄起大胡子的萨达姆，与当地人并无区别。
据美军线人讲，萨达姆最初每四小时就要更换藏身点，且从不在同一个藏身点睡两个晚上，而事实却并非如此。逃亡中的萨达姆，如觉得某个地方比较安全，他便会在此住上一礼拜左右。若有风吹草动，他便即刻转移。
风声比较紧的时候，萨达姆一晚上要转移好几次，才会在草垫上入睡。萨达姆每次更换藏身地点都是采用徒步或乘坐小船，偶尔也会乘坐出租车。有几次转移时正好遇到美军搜查，萨达姆躲在卡车集装箱逃脱。
萨达姆逃亡中只随身带三个人，如果某人有叛变迹象，萨达姆就会将其就地正法。据美情报人员称，最初有二十多人与萨达姆一起逃亡，最后只剩下身边两个人。部族成员的忠诚也是要用大量金钱来维持的。
曾接待过萨达姆的一家农户说，萨达姆在他家住了一晚，给她支付了三千美金作为保密费。萨达姆从来不吃住户的饭菜，甚至连水都不喝，他的食物都是随身携带。蜂蜜、水果罐头和巧克力，就是他的食物。
萨达姆逃亡虽然很狼狈，但他仍梦想着东山再起。他通过古老的信使来指挥支持者对美军的反击，大约共有十个袭击小组听其指挥。据萨达姆助手交代，萨达姆还与两个儿子在流亡时见过几次面。
在逃亡三个月后，乌代和库塞被美军击毙在摩苏尔。受到打击的萨达姆，一连几天都情绪非常低落。此时的萨达姆早已放弃了军装和名牌，穿着与家乡农民无异。虽然是疲于奔命，但萨达姆还是很注重享受的。
他的行李除了消毒水、洗发水、牙膏外，还有名牌香水和换洗的四五套衣服。萨达姆喜欢的开心果、千层酥、咖啡和立顿红茶，一样都不能少。逃亡中的萨达姆，通常是用看《古兰经》和《罪与罚》来打发时间。
同年十一月，美军加紧搜捕，萨达姆活动受到很大限制，一个月都没刮过胡子，携带的食品所剩无几且都已过期。萨达姆最后是居住在贾西姆的农场，此人曾接待过年轻时的萨达姆，如今是他的儿子挺身而出。
贾西姆的儿子卡伊斯将萨达姆藏在地洞中，他的家人包括妻子都不知道此事。在线人的告密下，萨达姆在地洞中被捕，卡伊斯和两个兄弟也被美军逮捕。据其姐姐透露，若非有人告密，美军是不可能发现萨达姆的。
美军后来也承认，早在六月份就曾搜查过这个农庄，但并未发现可疑之处。美军是从抓获的袭击者的身上得知了萨达姆的信息，导致其被抓。据说，萨达姆在被捕前，还曾向美军吐口水，在遭到拳打脚踢后就范。
萨达姆被捕的这天是2003年12月13日，至此萨达姆二百多天的逃亡生涯结束。三年后，萨达姆被判处绞刑。
