历史上中医开宗立派的不止黄元御一人。那么什么是“主流”？一般认为，中医的基本理论是由黄帝内经奠定的，符合黄帝内经的理论，就属于主流。从这个意义上，黄师理论应该属于中医主流。但是在主流中各开宗立派者，各自的特色又五花八门，形成主流中的不同流派。大概题目的真正意思是问，为什么大部分人并不承认黄师的理论是中医顶级理论？
中医的非主流流派则比较单纯，认为医圣张仲景的经典著作伤寒论才是中医的奠基之作，而且伤寒论并非传承于黄帝内经，是与内经无关的。
不要小看中医存在主流和非主流这个事实，这说明中医的“正名”并没有完成，这事关系到中医真正发扬光大、兴盛发展的大事。问题的关键点在于:
西汉以后，是否原始的素灵已经失传？如果认为黄帝内经是中医理论奠基者，就必须举出令人信服的素灵古本影件，同时论证伤寒论的基本理论与古灵素理论一致。目前我们所看到的内经，基本是从唐杨上善的著作和王冰的黄帝内经校注中获得，而且隋唐之前基本都没有黄帝内经这个提法，而古本灵素又没有确切的版本。而且，唐以后的黄帝内经的内容和伤寒论实在相差甚远。另外，黄帝内经得到重视，乃是宋徽宗的功劳。这就更使人怀疑中医理论奠基于黄帝内经了。
如果历史考证能够有力拿出汉以前直至张仲景时灵素，则才有可能支持中医目前的主流理论。如果历史考证不能证明这点，则应当抛弃目前的主流理论，而应当确立中医奠基理论是伤寒论，完成中医的正名。毕竟，目前看到的黄帝内经，其内容非常杂乱，也没有具体汤液学的内容，不足以使人信服它就是中医主流理论。
