讨论这个问题需要定义一个范围，什么是才能。这个词可大可小，这里我们探讨政治才能、军事才能、选贤任能才能、对文化历史贡献才能。
1）政治才能：嬴政对内高压政治，法度过严，目前历史猜测应征不是病死是被毒死（感兴趣可自己了解），孙权在政治上外交内政治理的也是井井有条，个人觉得嬴政微弱优势胜出（毕竟管辖区域大，管理维度更多）：
2）军事才能：我们算自己亲自带兵（不是手下将领）。孙权濡需口，十几万被张辽几百骑干的东吴小儿不敢夜啼！嬴政虽然自己带兵记载不多，但征讨北方，也是取胜。嬴政完胜。
3）用人：孙权早年任用周瑜、张昭、鲁肃、陆逊，个个都是三国顶级大才，可见孙权用人能力之强，当然应征也不弱，虽然逼死武安君白起，但那是白起已经不重要了，不过用赵高、李斯这样的给他减分不少。用人上，孙权获胜。
4）历史贡献：毫无争议嬴政胜，统一文字货币度量衡，车同轨。建立标准是嬴政最大的历史贡献，方便日后形成整体的中华文明圈。
综上，嬴政2.5比1，嬴政胜出。
个人认为嬴政更有才能。
从地位上来说，嬴政创立了我国历史上第一个封建主义王朝，可以说嬴政是真真正正的千古一帝，一统六国，车同轨，书同文，南击百越，北抗匈奴，即使统一全国后也没有滥杀功臣。而孙权，只能说是三国时期的一个诸侯，从地位上来说，孙权根本不能和嬴政相比。
从成长环境来说，嬴政成长中吕不韦的影响很大，吕不韦因为奇货可居，一跃成为战国时代最强国家秦国的权利最大的大臣，嬴政要面对吕不韦的压力，要获得国家实际意义上的控制权，这其中的艰辛自然不必多说。还有嫪毐之乱，可以说，嬴政的成长环境并不是多么好。孙权虽然早年失去父亲的庇佑，和哥哥孙策寄居在袁术的手下，孙策承担的压力肯定要比孙权大得多。而且后来孙吴的疆土基本上都是孙策打下来的，孙权只是接收了自己哥哥的基业罢了，和始皇嬴政相比，孙权还是要幸福的多的。
从执政集团上来讲，始皇帝嬴政的执政集团几乎囊括了当时中国最顶尖的一部分人群，王翦，蒙恬，蒙毅，尉缭，李斯，顿弱，姚贾等等，这些人各司其职，使整个秦国能够迅速的一统天下，如果嬴政没有识人用人之能，这些人又如何能够聚集在他的身边。而且嬴政统一天下后，虽然有被刺杀的风险，但是六国贵族几乎无人敢反叛，敢起兵作乱与始皇争锋。嬴政死后，秦国一个少府章邯都能将农民起义军打得哭爹喊娘，更何况嬴政时期的那些将领了。而孙权呢，执政集团内部多是世家子弟，赤壁之战前内部还为与曹操集团争战之事争议不休，而且在三国中，孙权集团的将领明显要远远不如曹操集团和刘备集团的。
因此我认为孙权不如嬴政。
